TEXMST Gene Info

Gene Name : transcription factor 4

GTEx V9

NCBI GeneID : 6925	NCBI : NM_001083962.2	NCBI : NP_001077431.1
Chromosome : 18	Strand : -
MANE Select : ENST00000354452	MANE Plus Clinical :

	Gene Symbol	Ensembl Gene ID	Start	End
MANE	TCF4	ENSG00000196628	55222185	55588192
GTEx V8	TCF4	ENSG00000196628	55222330	55664787
Gencode v40	TCF4	ENSG00000196628	55222184	55664787

Gencode v26 (GTEx V8)											Gencode v40
V8 TRP-Tx	Transcript ID	Exon Count	Transcript Length	Tx Length Rank	CDS Length	CDS Rank	Exp Tx%	Exp Rank	MANE Match	APPRIS	Transcript ID	Exon Count	Transcript Length	Tx Length Rank	CDS Length	CDS Rank	MANE Match	APPRIS
	ENST00000635990	15	7396	12	0	72	34.36	1			ENST00000635990	15	7396	14	0	74
	ENST00000637923	14	7314	13	298	64	14.19	2			ENST00000637923	14	7314	15	298	65
	ENST00000562680	14	5733	15	0	72	7.41	3			ENST00000562680	14	5733	17	0	74
☉	ENST00000630720	9	1552	40	945	31	5.47	4			ENST00000630720	9	1552	44	945	33
	ENST00000627685	9	882	46	612	40	4.35	5			ENST00000627685	9	882	50	612	42
	ENST00000637239	18	7771	8	0	72	3.11	6			ENST00000637239	18	7771	9	0	74
	ENST00000637115	21	7883	5	153	71	2.91	7			ENST00000637115	21	7883	7	153	73
	ENST00000638154	19	7801	7	2013	5	2.78	8			ENST00000638154	19	7946	6	2043	2
	ENST00000563760	7	856	48	0	72	2.39	9			ENST00000563760	7	856	52	0	74
	ENST00000626631	2	622	64	246	65	2.19	10			ENST00000626631	2	622	67	246	66
	ENST00000627784	7	601	67	468	51	1.79	11			ENST00000627784	7	601	70	468	52
	ENST00000626466	6	1004	43	0	72	1.74	12			ENST00000626466	6	1004	47	0	74
	ENST00000636751	20	8283	3	309	63	1.42	13			ENST00000636751	20	8283	3	309	64
	ENST00000637169	13	7553	10	1368	29	1.37	14			ENST00000637169	13	7553	12	1368	31
	ENST00000570146	4	661	60	500	46	1.35	15			ENST00000570146	4	661	63	500	47
	ENST00000626595	10	833	49	663	37	0.85	16			ENST00000626595	10	833	53	663	39
	ENST00000570287	13	3163	19	1524	27	0.65	17			ENST00000570287	13	3163	20	1524	29
	ENST00000628360	2	463	81	0	72	0.64	18			ENST00000628360	2	463	84	0	74
	ENST00000616053	18	8140	4	1752	20	0.58	19			ENST00000616053	18	8140	4	1752	20
	ENST00000565908	9	805	54	629	38	0.56	20			ENST00000565908	9	805	58	629	40
	ENST00000356073	20	8317	2	2004	6	0.54	21		A:1	ENST00000356073	20	8317	2	2004	6		A:1
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	ENST00000457482	13	2372	27	1536	26	0.48	23			ENST00000457482	13	2372	28	1536	28
	ENST00000636400	20	8343	1	1944	9	0.44	24			ENST00000636400	20	8343	1	1944	9
	ENST00000628689	7	721	58	243	67	0.43	25			ENST00000628689	7	721	61	243	68
	ENST00000637250	15	7410	11	0	72	0.39	26			ENST00000637250	15	7410	13	0	74
	ENST00000625925	7	606	65	405	55	0.37	27			ENST00000625925	7	606	68	405	56
	ENST00000543082	18	2399	25	1878	15	0.37	28			ENST00000543082	18	2399	26	1878	15
	ENST00000566376	4	462	82	0	72	0.36	29			ENST00000566376	4	462	85	0	74
	ENST00000563686	8	6012	14	0	72	0.35	30			ENST00000563686	8	6012	16	0	74
	ENST00000566777	7	653	61	403	58	0.34	31			ENST00000566777	7	653	64	403	59
	ENST00000561831	13	1823	38	1524	27	0.34	32			ENST00000561831	13	1823	42	1524	29
	ENST00000637068	2	142	89	0	72	0.30	33			ENST00000637068	2	142	92	0	74
	ENST00000568740	19	2628	22	1929	13	0.29	34			ENST00000568740	19	2628	23	1929	13
	ENST00000398339	21	2551	24	2322	1	0.28	35			ENST00000398339	21	2551	25	2322	1
	ENST00000562030	7	1084	42	538	42	0.28	36			ENST00000562030	7	1084	46	538	44
	ENST00000564403	20	2696	21	2034	2	0.28	37		A:1	ENST00000564403	20	2696	22	2034	3		A:1
	ENST00000563824	6	897	45	476	50	0.24	38			ENST00000563824	6	897	49	476	51
	ENST00000635822	20	7805	6	1896	14	0.23	39			ENST00000635822	20	7805	8	1896	14
	ENST00000561992	16	2184	30	1614	23	0.22	40			ENST00000561992	16	2184	31	1614	25
	ENST00000628078	8	1277	41	622	39	0.20	41			ENST00000628078	8	1277	45	622	41
	ENST00000540999	19	2572	23	1932	12	0.18	42			ENST00000540999	19	2572	24	1932	12
	ENST00000630828	7	735	57	685	35	0.17	43			ENST00000630828	7	735	60	685	37
	ENST00000564228	16	1915	36	1791	19	0.17	44			ENST00000564228	16	1915	39	1791	19
	ENST00000568186	5	583	71	358	61	0.17	45			ENST00000568186	5	583	74	358	62
	ENST00000537856	15	1996	34	1614	23	0.16	46			ENST00000537856	15	1996	36	1614	25
	ENST00000626425	8	579	72	537	43	0.14	47			ENST00000626425	8	579	75	537	45
	ENST00000630712	6	831	50	386	59	0.14	48			ENST00000630712	6	831	54	386	60
	ENST00000566286	19	2119	32	1995	8	0.09	50			ENST00000566286	19	2119	33	1995	8
	ENST00000628636	9	826	51	674	36	0.09	51			ENST00000628636	9	826	55	674	38
	ENST00000568673	19	2398	26	1944	9	0.08	52			ENST00000568673	19	2398	27	1944	9
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	ENST00000567880	17	1948	35	1824	17	0.08	56			ENST00000567880	17	1948	37	1824	17
	ENST00000565018	17	2357	28	1752	20	0.07	57			ENST00000565018	17	2357	29	1752	20
	ENST00000563888	7	570	73	438	53	0.07	58			ENST00000563888	7	570	76	438	54
	ENST00000562607	6	602	66	491	48	0.05	59			ENST00000562607	6	602	69	491	49
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	ENST00000569357	7	585	70	373	60	0.04	63			ENST00000569357	7	585	73	373	61
	ENST00000630268	6	635	62	465	52	0.04	64			ENST00000630268	6	635	65	465	53
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	ENST00000564343	6	568	74	405	55	0.02	75			ENST00000564343	6	568	77	405	56
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	ENST00000562638	5	401	83	356	62	0.01	79			ENST00000562638	5	401	86	356	63
	ENST00000566279	18	2128	31	1836	16	0.01	80			ENST00000566279	18	2128	32	1836	16
	ENST00000569012	6	561	75	488	49	0.01	81			ENST00000569012	6	561	78	488	50
	ENST00000354452	20	3482	18	2016	3	0.01	82	☀	P:3	ENST00000354452	20	8041	5	2016	4	☀	P:3
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Gencode v26 (GTEx V8)											Gencode v40
V8 TRP-Tx	No Match Transcript ID	Exon Count	Transcript Length	Tx Length Rank	CDS Length	CDS Rank	Exp Tx%	Exp Rank	MANE Match	APPRIS	No Match Transcript ID	Exon Count	Transcript Length	Tx Length Rank	CDS Length	CDS Rank	MANE Match	APPRIS
	ENST00000625849	7	784	55	534	44	0.14	49			ENST00000000000
	ENST00000000000										ENST00000637500	2	100	93	0	74
	ENST00000000000										ENST00000643689	15	7577	11	1626	22
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	ENST00000000000										ENST00000675707	16	1935	38	1626	22

ENSG00000196628 TCF4

TPM Log2 Log10